概要
境内入口の巨大な仁王門は鉄筋コンクリート造で、出雲大社の大鳥居などでも知られる小林徳一郎の寄進で1920年（大正9年）に建立された。国の登録有形文化財に登録されている。門をくぐると桜並木の長い参道が続き、両側に12の塔頭が並ぶ。
参道を進むと右手に本妙寺の大本堂（勅願道場）がある。そこから先には胸突雁木（むなつきがんぎ）と呼ばれる176段の急勾配の石段があり、その中央に信者から寄進された多数の石灯籠が並んでいる。これを登ったところに浄池廟があり、境内の宝物館には清正の遺品や加藤・細川家に関する文書・書画・工芸品・鎧兜等、国の重要文化財を含む約1400点が収蔵、展示されている。
かつては宿泊する参拝客も多かったというが、今は浄池廟の手前に1軒だけ古い旅籠が残る。さらに浄池廟の裏手から300段の石段を登ると、鑓を持ち長烏帽子形兜を被った清正像が立っている。ここからは熊本市内をよく見渡すことができる。
毎年清正の命日である7月24日の前夜、僧侶や信者が写経した法華経を奉納する頓写会（とんしゃえ）が行われ、10万人の参拝客で賑わう。清正の一周忌に本妙寺第三世日遥が法華経一部八巻を一夜で写経し、追善供養したことが起源とされる。
歴史
1585年（天正13年）、加藤清正の父・清忠の冥福を祈るため、日真の開山により大阪に開創されたのに始まる。清正が熊本城主になった後の1600年（慶長5年）、熊本城下に創建されていた瑞龍院に移された。1611年に清正が没し、遺言により中尾山上の浄池廟に清正像を奉安した。1614年（慶長19年）、火災で焼失した本妙寺を浄池廟下の現在地に移転した。
明治時代の神仏分離令によって浄池廟と本妙寺は神社と寺として分けられ、1871年（明治4年）に社殿だけが熊本城内に移され、加藤神社となった。浄池廟の拝殿も撤去された。その後、西南戦争で焼失した大本堂と同時に浄池廟の建物も再建され（明治27年）、現在の姿になった。
交通アクセス
路面電車
熊本市電B系統本妙寺入口電停下車、西へ約1.1Km（山門まで約400m）。
路線バス
熊本桜町バスターミナルより以下の路線に乗車
熊本都市バス柿原公民館ゆきで本妙寺前バス停下車、西へ約900m（山門まで約200m）。
九州産交バス河内温泉ゆきで花園バス停下車、北へ100m、西へ約200m。
自家用車
九州自動車道熊本インターチェンジより10㎞
所在地 熊本県熊本市西区花園4-13-1
位置 北緯32度49分0.4秒 東経130度41分22.4秒
山号 発星山
宗派 日蓮宗六条門流
寺格 六条門流九州総導師
本尊 十界曼荼羅
創建年 1585年（天正13年）
開基 加藤清正、日真（開山）
文化財 仁王門（登録有形文化財）
短刀 銘光世・紙本墨書日本紀竟宴和歌上下2巻ほか（国の重要文化財）
安南国書（国の重要美術品）
短刀 備州長船祐定・刀 同田貫正国（県文化財）
