マイクロンの章という前回の続きでアルケモア号の囚人と戦う話と、新たなる敵という復活したスタースクリームと戦う話に別れる。
設定面ではプライムを引き継いでいるものの、プライムからのキャラはごく一部な上に外見が大幅に変わっている。
一応新章でキャラも増えているものの、OPEDはそのまんま、その為追加キャラが全く反映されていない状態になっている。
アドベンチャーの話（シーズン1）前提なのと、キャラが増えたため複数チームで行動した結果、それぞれが並行して描写するため、話はTFとしてはやや分かりにくい。
マイクロンの章というタイトルなのでマイクロン（小型のトランスフォーマー）が登場するものの、長期的に出番があるマイクロンは少なめで多くがゲスト扱い。
キャラが増えすぎたためか、それぞれのラストである程度人員整理らしき事が行われ、もし3シーズンをやる場合の準備っぽい事が行われ、一部キャラはサイバトロン星へ帰還する事に。
ラチェットの発言から、サイバトロン星の新政府では、オプティマスを先の対戦の戦犯とする動きがサイバトロン星にあり、割と伏線状態に。
あらすじ
あらすじ（マイクロンの章）
メガトロナスを退治したものの、まだディセプティコンは地球に残っており、未だバンブルビーたちは地球に留まっていた。しばらくオプティマスの体力回復等を図ってオートボットたちはしばらくディセプティコンの捜索を控えていたが、再び活動を再開。しかし肝心のオプティマスは未だに病み上がり状態だったが、無理してでも現場に出たがり雪山へ出撃、危機に陥ってしまう、がオプティマスは気力はMAXであり、割と元気にディセプティコンを捉える。その頃留守番をしていたバンブルビーの近くにもディセプティコンが出現する、これもまたバンブルビーによってなんとか捕らえる事に成功する。しかしその裏では前回逃走したスチールジョーが再び仲間を集めていたのだが、偶然発見したキックバックからディセプティコンが別のグループを作っていることを知ることになる。さらにディセプティコンの中に囚人データベースに載っていない者が出てくるのだった、そして調査した結果囚人名簿が細工されていた事が判明するのである。
そしてその内に新しい敵が登場し、囚人を使い組織を作り海賊として活動するために動いていた。
あらすじ（新たなる敵）
ディセプティコン島との戦い以降もっぱら観光ばかりだったオートボット。今度はバンブルビーによってプライム時代の基地へ案内されていた。しかし基地のセキュリティが反応してバンブルビーたちを攻撃し始める。そして基地内にディセプティコンとマイクロンのチームが侵入していたのであった。しかしディセプティコンと比べマイクロンには敵意が見えずあまり積極的に攻撃してこない。
侵入していたディセプティコンはスカベンジャーズといい、地球へはかつての戦い（プライムの戦い）で使用されたトランスフォーマーの武器が残っており、それを集めに来たのであった。ところがスカベンジャーズはマイクロンを連れている、そしてそのマイクロンはスカベンジャーズには協力的ではない事が何度も戦う内にわかってくる。
そしてスカベンジャーズとの戦いが続くなか、突如としてスタースクリームが出現、スカベンジャーズが発見したダークエネルゴンセイバーを奪う。マイクロンたちは隙を見て逃走したが、スタースクリームの目的はマイクロンたちであり、逃走先のオートボット基地に部下を送り込んで、間違えてフィクシットと弟子2人のマイクロン3人を攫って行った。仕方ないのでそのマイクロンを人質にバンブルビーを連れて行く、そしてなぜプレダコンを滅ぼして姿を変え、ハイパーマイクロンを見つけるまでの経緯が一部おかしな点を含んで語りだしたのである。
登場メカ
何割かは前回からの引き続きで登場、色違い系のキャラも多少有り。
オートボット
何やらサイバトロン星がキナ臭いがあんまり描写はない。バンブルビーらは地球に留まって相変わらずディセプティコンと戦い続けている。
オプティマスプライム
司令官、シーズン1の終盤に合流してそのまま留まっている。病み上がりのため序盤は力を発揮できていなかった。ノルマである落下シーンは真面目にこなしている。サイバトロン星では死んだことになっている。
マイクロンの章の最後に一度地球を離れたが、新たなる敵の終盤に復帰する。現在のところサイバトロン星には帰還していない。
バンブルビー
チームバンブルビーを率いている。新たにオプティマスが加わったため、オプティマスとは喧嘩が絶えない。
サイドスワイプ
主にウィンドブレード、ストロングアームとの絡みが多い。ウィンドブレードには忍者と言われる。車体に文字が書かれているがフォントが割としょぼい。
ストロングアーム
パトカー型、割とグリムロックとの絡みが多い。悩みも多くミスで落ち込む。
グリムロック
ティラノサウルス型。2010を下敷きにした天才化回があるが、元ネタの元ネタであるアルジャーノンに花束をのとおり、大量のデータにより知能が崩壊する問題と、戦闘力の低下に悩まされる事になる。
目立つために任務に参加できない事が多いが、クレーンに変装して無理やり出撃する。
ウィンドブレード
飛行機型かつ隈取顔のTF。引き続き登場。サイドスワイプと組んだりしている。
ドリフト
侍風TF。賞金稼ぎだったが、現在チームバンブルビーに所属している。グリムロック曰くツンデレ侍。
スリップストーム、ジェットストーム
マイクロン、引き続き登場。ドリフトの弟子、そろそろ独り立ちしたい感じ。普段はドリフトにくっついている。
ラチェット
かつてのオプティマスの仲間。なんとサイバトロン星の政府がオプティマスを戦犯として捉えようとしている事に反対して星を追われ、ディセプティコン残党の任務に就いている。ラチェットは地球に車ではオプティマスの現状を聞いていなかった模様。
アンダートーン
ラチェットとともに行動しているマイクロン。寡黙。
フィクシット
アルケモア号の看守。相変わらず壊れかけ。
トゥールボックス
フィクシットと同じ外見のマイクロン。前作でも登場したが、今ひとつポジションがわからなかった。本作ではディセプティコンに操られている。その後フィクシットに協力してスチールジョーを攻撃。
ディセプティコン（前作より引き続き）
引き続きアルケモア号の囚人が登場。
スチールジョー
前回から引き続いて登場。前回のラストでメガトロナスに騙されその後捕まらないままフェードアウトしていたが、潜伏しており活動していた。グロウストライクの組織に参加する振りをして裏切り組織を乗っ取る。「ディセプティコンが裏切るのは珍しいことではない」との事。
スチールジョーの目的自体は地球をディセプティコンの新たな故郷とすることで変わっていない。
キックバック
バッタ、グロウストライクの組織に参加していた。
サンダーフーフ
引き続き登場のシカピョン。スチールジョーによって開放されるがまた捕まってしまう。
クランプダウン
スチールジョーに解放される。蟹、基本ギャグキャラ、ネタキャラ。ラチェットが来た時にあっけなく捕まる。
ビスク
スチールジョーによって解放、多分海老かなんか。コンサート会場でバンブルビーと乱闘して再び捕まる。なおその騒動はコンサートの演出っぽい扱いで処理。
クイルファイヤ
革命戦士、やはりスチールジョーによる開放組。グリムロックの変装にやられる。
スプリングロード
カエル、一応登場するが消息不明。
グランドパウンダー
格闘家。スチールジョーによる解放組、再びやられる。
ディセプティコン（マイクロンの章より登場）
基本的にアルケモア号の囚人、スチールジョーとは別にグロウストライクによって組織化されていた。最終的にスチールジョーに組織を乗っ取られる。
グロウストライク
新たにアルケモア号の囚人を組織化していたが、スチールジョーに乗っ取られる。
セイバーホーン
カブトムシ型騎士TF。グロウストライクの部下の一人だったが、スチールジョーの裏切りの時にやられてしまう。
スコルポノック
蠍型、グロウストライクの部下。
ブラジオン、クラウト
スコルポノックの部下。
アンヴィル、ハンマー
ビスクと共に行動する。ビスクとともにやられる。
バック、フォース
クイルファイヤと共に行動する。クイルファイヤと共にやられる。
ポーラークロー
1話に登場、2話でオプティマスに捕まる。シロクマ。
オーバーロード
俳優らしく、芝居かかった動きが多い。変装の名人。
ランサック、バックトラック
オーバーロードとセットで活動していたマイクロン。中身は子供らしく、バンブルビーに手懐けられてあっさりオーバーロードを裏切る。
レザーパウ
アルケモア号の囚人リストに載っていないディセプティコン。
グラシウス、スウェルター
レーザーパウとともに行動するマイクロン。
シマコア
サルのマッドサイエンティスト。実験に失敗すると暴れる危険人物。
アクシオン、セオレム
シマコアの助手のマイクロン。
トーポー
モノアイのマイクロン。
ストッケード
多数のメジャー・メイヘムを引き連れている。将軍だったらしいが、なんの戦争でなんの活躍をした将軍なのだろうかは不明。
メジャー・メイヘム
ストッケードの部下、やたら沢山いる。
クレイジーボルト
走り屋ディセプティコン。自分の走りを邪魔するものは全部破壊する。アクセルぶっぱなして未来を切り開くぞと言っている。
スライスダイス
クレイジーボルトの相棒マイクロン。オッドアイ、同じく走り屋で暴走気味。
ディセプティコン（新たなる敵に登場）
クロートラップ
スカベンジャーズのリーダー、ハイパーマイクロンと協力関係になっているが信用は全くされていない。外見はクランプダウンの色違いだが目が妙にキリッとしており、声も太くシリアスモード。地球で宝探しをしていたが、スタースクリームの登場であっけなくやられる。その後再びほかのメンバーと合流し、古い武器を集めてハイパーマイクロンを奪い返そうとオートボットに襲いかかる、しばらくは優勢だったがマイクロンがオートボットに加勢したためにやられてスカベンジャーズは全滅する。
パラロン
スカベンジャーズのメンバースコルポノックの色違い。ヒゲが生えててややおっさん顔。
スキャッタースパイク
スカベンジャーズのメンバークイルファイヤの色違い。スカベンジャーズ全体は仲が良くない。
サーミドー
スカベンジャーズのメンバー、外見はビスクの色違い、元々スカベンジャーズの宇宙船の持ち主。クロートラップ以外の3人は後にスタースクリームが登場した時にまとめて吹っ飛ばされて海ぽちゃ。
シェードロック
スタースクリームの傭兵。金で雇われているらしいが今のところ給料は未払っぽい。ハイパーマイクロンを連れ去ろうとして間違ってフィクシットたちを連れて行ってしまった。最終回でラフェッジらと逃走を図るも捕まる。
ラフェッジ
スタースクリームの一味の一人。
インセクティコン（名称不明）
スタースクリームの一味、傭兵。
ディセプティコン（プライムより登場）
スタースクリーム
スタスク、プライムより引き続き登場。外見は変わっているが回想を見る限りプライムのスタスク。口で言ってることと回想シーンが真逆な辺がスタースクリーム。小物のままだが予告編では一応大悪党扱いである、さらにストロングアームからも「あの」スタースクリーム扱いである。
ハイパーマイクロンを確保してパワーアップを図るもすぐに逃げられてしまい、それを追って地球にやってきた。最終回でパワーアップしてオプティマスと戦う。
サウンドウェーブ
音波、長らくシャドウゾーンを彷徨っていたが復活。しかし再びシャドウゾーン行き。
ハイパーマイクロン
新たなる敵より登場するマイクロン。どうもスカベンジャーズとは嫌々ながら協力関係になっている。そのためかオートボットに対する態度は敵対的ではない。基本的に全員武器にトランスフォームする。
スカベンジャーズがダークエネルゴンセイバーに気を取られている時に隙を突いて逃走。
メガトロンに捕まって遺伝子レベルで改造されており、7体のマイクロンが全てTFと合体することでハイパーサージモードになるとプライムをも凌ぐパワーが得られる。
エアロボルト
ハイパーマイクロンのリーダー格。鳥。ディセプティコンと協力しているが、乗り気ではない。
ソートゥース
サメ、オートボットの方が信用できると言う発言をする。
トリケラショット
トリケラトプス。ダイノボットのためかグリムロックには割と友好的。
バッシュブレーカー、ウィンドストライク、ランスロン
その他のハイパーマイクロン、ほかのハイパーマイクロンと共に行動している。
その他
シミュレーター
サンダーフーフをモデルにしたホログラムをドローンに投影して戦闘訓練を行う機械、ほかのディセプティコンの投影ができるかは不明だがドローンは完全にサンダーフーフ用といった感じ。壊れて暴走して暴れまわる。
スマホ
子供があまりにも危機的状況でさえスマホいじりをしていたため、父親に投げ捨てられた。
感想他
やや話の要素が増えすぎた感が有ります、元々多かったキャラが結構増えて来たので。
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