常楽寺、長寿寺とともに湖南三山の1つに数えられる。
歴史
中世以前の沿革はあまり明らかでないが、伝承では奈良時代の和銅年間（708年 – 715年）に元明天皇が国家鎮護の道場として建立し、和銅寺と称したという。
その後、平安時代の初期に最澄が入山して池から出てきた薬師如来を本尊として請雨の祈祷をし、天台寺院に改めた上で延暦寺の別院諸堂を建立したという。
桓武天皇が病気になった際、最澄が法力により当寺の霊水を献上したところ、たちどころに回復した。これによって天皇から岩根山善水寺の寺号を賜わったという。
その後に境内は広げられ、本堂のある地を中尾、清涼山を東尾、岩根山を西尾といい、塔頭が計26ヵ坊存在していた。なかでも岩根山は善覚院、中之坊、角之坊、岩蔵坊、持蓮坊、宝泉坊、角心坊、善明坊、浄心坊、大門坊、宝乗坊、実蔵坊の十二坊があった。これにより岩根山は十二坊山とも呼ばれた。
1953年（昭和28年）に大雨により仁王門が流失した。
文化財
国宝
本堂 附：厨子 1基
交通アクセス
JR草津線 甲西駅下車 バス11分 岩根バス停下車 徒歩10分 車10分
名神竜王IC 20分
駐車場
普通車30台、大型車4台
所在地 滋賀県湖南市岩根3518
位置 北緯35度0分23.2秒 東経136度6分45.2秒
山号 岩根山（いわねさん）
院号 醫王院
宗派 天台宗
本尊 薬師如来（秘仏、重要文化財）
創建年 和銅年間（708年 - 715年）
開基 元明天皇（勅願）
正式名 岩根山醫王院善水寺
別称 和銅寺
札所等 西国薬師四十九霊場第47番
甲賀西国三十三所第21番
びわ湖百八霊場第93番
湖南三山
文化財 本堂（国宝）
木造薬師如来坐像、木造梵天・帝釈天立像、木造兜跋毘沙門天立像ほか（重要文化財）
