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2019年06月23日

非翻訳領域(ノンコーディングDNA)

ゲノムDNAにはタンパク質に翻訳されるコーディングDNA(いわゆる遺伝子)とタンパク質に翻訳されないノンコーディングDNAと呼ばれる部位が認められる.ノンコーディングDNAもそのDNA配列自体が制御領域として働いている場合やRNAに転写されてRNAが何らかの役割を持って働いている場合がある.











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posted by Alice at 00:00| Comment(0) | TrackBack(0) | DNA

2019年06月01日

ウェブ画面をテキストファイルとして保存する

 コンピュータにインストールされたウェブブラウザを用いるとインターネット上の情報を容易に閲覧できる.今回はウェブブラウザであるファイアフォックスを用いて検証する.
Screen Shot 2019-02-27 at 10.16.23.png

 ウェブ画面に表示されたウェブページを保存する場合に,HTML形式(.html)でファイルとして保存した場合にウェブブラウザでの閲覧は容易であるが,ターミナル等でファイルを開いた場合にソースコードとしてhtmlタグも同時に表示される場合がある.このためウェブページを保存する際にテキストファイル形式(.txt)のページも併せて保存することが望ましいと考えられる.次のような画面を保存する場合を見てみる.
Screen Shot 2019-02-27 at 9.00.42.png

 ファイアフォックスのメニューにある[ファイル](File)⇨[別名でページを保存](Save Page as ...)を選択する.

Screen Shot 2019-02-27 at 10.31.21.png

 ファイル名を指定して保存する際に,ファイル形式を指定できる.今回はダウンロードというディレクトリにテキスト形式を選択してファイルを保存する.
Screen Shot 2019-02-27 at 9.04.47.png

 ターミナルからRを起動して先ほど保存したファイルを読み込んで確認してみると,次の通り認識してくれているようである.
Screen Shot 2019-02-27 at 12.41.52.png

 テキストファイルを閲覧,書き込み,保存できるソフトウェアであるテキストエディタも高機能となり,必ずしもファイル形式に注意を払わなくても支障なくなってきているが,長期保存や互換性などを考えるとテキスト形式でファイルを保存する場面はまだありそうである.

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2019年05月08日

リンの含有量が多い食品

加工品

乳製品は一般的にリンの含有量が高い

チーズ
ヨーグルト
クリーム
カスタード
プリン
アイスクリーム
ミルク
キャラメル

飲料水

他の食品にも共通するが乳,豆が使われている場合はリンの含有量が高い

ミルク(牛乳,豆乳など)
豆乳
ビール
エール
コーラ
ココア
チョコレートドリンク
玉露
缶ジュース
缶コーヒー

タンパク質

内臓は一般的にリンの含有量が高い

肝臓(牛肉,鶏肉など)
モツ
エビ
魚卵
イワシ

牡蠣

野菜

豆類は一般的にリンの含有量が高い

豆類

その他

穀類は特にその外套部分である外皮に多く,リンが含まれており次に胚芽に含まれている

ぬか
玄米
全粒粉食品
小麦胚芽
ビール酵母
ナッツ





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posted by Alice at 00:00| Comment(0) | TrackBack(0) | 臨床医学

2019年05月02日

転移性腎腫瘍(腎転移)

 進行癌ではしばしば遠隔転移が認められるが,あまり聞きなれないかもしれないが腎にも遠隔転移が認められる.臨床症状としては血尿や巨大な腫瘍となると側腹部痛が認められる.特に血流が豊富な健康な腎ほど転移性腫瘍の母地となりやすいとされている.原発巣としては主に肺がん,消化器がん,乳がんが挙げられる.

 転移性腎腫瘍は両腎に多発性に認められる.腫瘍中心部は壊死が認められる.また出血してのう胞状に変化している腫瘍も認められる.尿検査や尿細胞診に加えて,腹部超音波検査,腹部CT検査などの非侵襲的な検査で発見される.

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posted by Alice at 00:00| Comment(0) | TrackBack(0) | 悪性腫瘍

2019年05月01日

悪性中皮腫

 肺は2枚の膜で包まれている.外側は肋骨などの胸壁の内側に張っている膜で壁側胸膜と呼ばれている.内側の膜は肺実質を覆っており臓側胸膜と呼ばれている.悪性中皮腫はアスベスト(石綿)への暴露で臓側胸膜から生じる白色の大きな腫瘍であり,しばしば胸部CT検査の結果などから鑑別される.胸部CT検査の骨条件で胸膜に連続した隆起性の軟部腫瘍として観察される.少なくとも初期には胸水貯留は観察されない.

 悪性中皮腫はアスベストへの最初の暴露から20-40年程度を経て発症すると言われており,少量の暴露でも原因となりうる.大量に暴露した場合には肺線維症を発症することもある.また,アスベスト暴露は気管(気管支)腫瘍の発症リスク因子であり,喫煙により増強される.

 悪性中皮腫には異所性腫瘍も報告されている.腹膜,心膜,精巣鞘膜から発生した症例報告がある.

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posted by Alice at 00:00| Comment(0) | TrackBack(0) | 悪性腫瘍

2019年04月20日

カタユウレイボヤ

 カタユウレイボヤ(Ciona intestinalis)はモデル動物として知られている.胚から幼生まで組織が透明で観察しやすく,成長過程も比較的早いといった利点がある.

 カタユウレイボヤの倍数性はヒトと同様に二倍体であると考えられる.

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posted by Alice at 00:00| Comment(0) | TrackBack(0) | モデル生物

2019年04月03日

モロニーマウス肉腫ウイルス(Moloney murine sarcoma virus)

 エンベロープ一本鎖プラスRNAウイルス.ssRNA(+).よく知られている宿主はマウス.ウイルスゲノムである一本鎖RNAを鋳型として二本鎖DNAが逆転写酵素に合成される.こうして合成されたDNAはウイルスインテグラーぜ(viral integrase)により,宿主のゲノムDNAの中に組み込まれれる.この状態をプロウイルス(provirus)と呼ぶ.プロはラテン語由来で"前"といった意味合いがある.宿主ゲノムに組み込まれて,RNAへの転写を待っている状態と解釈すると理解しやすいと思われる.












posted by Alice at 00:00| Comment(0) | TrackBack(0) | ウイルス

2019年04月02日

ポリオーマウイルス

非エンベロープ二本鎖環状DNAウイルス






posted by Alice at 00:00| Comment(0) | TrackBack(0) | ウイルス

2019年04月01日

ウイルスの基本構造

 ウイルスカプシドと呼ばれるタンパク質で出来たを持ち,その中に遺伝情報となる核酸(DNAまたはRNA)を持った構造をとっている.種類によってはエンベロープ(外套)という膜を持っている.ウイルスは単一では増殖することが出来ないと考えられており,宿主となる細胞に寄生して細胞内器官を利用して自らの複製,増殖を図っている.

 ウイルスは宿主となる細胞を必要とするが,宿主の種類によって動物ウイルス,植物ウイルスに分類される.細菌を宿主とするウイルスは特にバクテリオファージと呼ばれている.










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タグ:ウイルス DNA
posted by Alice at 00:00| Comment(0) | TrackBack(0) | ウイルス

2019年03月20日

卵割

posted by Alice at 00:00| Comment(0) | TrackBack(0) | 発生学
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