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厚生労働大臣は辞任し事務方トップの事務次官や課長クラスはクビだろう。
違法行為をしていた上に、隠蔽工作までするのだから国家公務員としてはあるまじき行為だ。
クビにするしかない。

Yahoo!より、
勤労統計の資料を廃棄　厚労省04〜11年分、再集計は困難
1/17(木) 20:52配信 毎日新聞
https://headlines.yahoo.co.jp/hl?a=20190117-00000089-mai-soci
記事より、
・厚生労働省の「毎月勤労統計」の不正調査問題で、不正なデータを補正するために必要な基礎資料のうち、2004〜11年分が紛失や廃棄されていたことが判明
・同省が17日の総務省統計委員会で明らかにした
・統計委員会の西村清彦委員長は統計として成立しない可能性に言及
・厚労省は引き続き資料を探す方針だが、政府の基幹統計に穴が開く異例の事態に発展する可能性
・厚労省は17日の統計委で、基礎資料がそろっていた12〜18年の補正結果を提出。統計委は「おおむね妥当」と判断し、政府統計として認める考えで一致した。しかし、厚労省は11年以前について「集計を行うためのデータが不足している」として補正結果を示さなかった
・西村委員長は統計委の会合後、「（基礎資料が）なければ（統計として）出せない」と述べ、このままでは政府統計として成立しない可能性を示唆した。総務省によると、基幹統計の正確な値を公表できない事態は過去に例がない
・不正調査問題を受け、政府は鈴木俊彦事務次官ら幹部職員を処分する方針

処分の内容は明らかにされていない。
だが、クビにする必要があり、また、しかもその数は今回の実質的な損失に見合う人件費に相当する分、将来も含めて人をカットする必要。